汇总：基因组学常用数据库、软件及下载链接

NCBI []

NCBI (National Center for Biotechnology Information）是就是指美国国立生可作技术开发的设备

EMBL []

东欧分子生可作学物理测试EMBL（The European Molecular Biology Laboratory）

DDBJ []

DDBJ(DNA Data Bank of Japan)，于1984年建立，是世界三大DNA 在线之一，与NCBI的GenBank，EMBL的EBI在线携手组成亚太地区DNA在线

CNGB []

中国人国家在线（China National GeneBank）设于佛山大鹏新的区，是先于世界三大在线之前的全球第四大国家级在线。它是中国人首个，也是唯一一个国家DNA库，相对于全球另外三个DNA库而言，国家DNA库混合物保存的规模、存储量和可回访的数据量皆是全球最大。

BIGD []

中国人国家DNA组物理的设备 生命与健康大的设备 (National Genomics Data Center BIG Data Center)

miRBase []

piRNAbank []

piRNAbank []

SILVA []

LncRNAdb []

真核生可作

LncRNAwiki [_Page]

人类长非解码RNA在线

Rfam[]

像是Pfam的RNA家部落正文在线

Human protein atlas [ ]

人体蛋白酶在细胞、组织、病理必须下的容含

Pfam []

Pfam是蛋白酶质家部落的在线，以外用到容解是假设生成的正文和多核酸判读。

SwissProt []

手动正文的非冗余蛋白酶核酸在线

UniProt [ ]

PIR []

Antibodies []

BRENDA [ ]

HPRD []

InterPro []

通过整合多个蛋白酶特别在线，提供了一个方便的对蛋白酶核酸顺利进行功能正文的平台，以外对蛋白酶质家部落、构造域、功能亚基的得出

iProClass []

PRF []

REBASE []

PDB []

通过测试测定的构造

SCOP []

CATH []

PSI []

PROSITE []

最更进一步

Pfam []

最专业

ProDom []

CCD []

Prints []

SMART [ ]

TIGRFAM []

STRING []

DIP []

测试验证的蛋白酶基本粒子在线

BioGRID [] ：

IntAct [ ]

MapMan：一个功能强大的糖类唯一可查看和编辑的软件

KEGG []

GO []

NCBI BioSystems []

IMP []

plantCyc []

MANET [ ]

MetaNetX [ ]

MataboLights []

HMDB []

YMDB []

ECMDB []

Planteome []

dbGaP []

IPPN []

GeneCard []

Gene Wiki[_Wiki ]

Blast []

Interproscan []，

WEGO []

KAAS []

FGENESH []

AUGUSTUS [ ]

GENESCAN []

GeneMark []

Glimmer []

Exon-Intron Graphic Maker []

根据候选DNA的胺基酸和内含子等数据绘制DNA构造

Blastp [_TYPE=BlastSearchWildLINK_LOC=blasthome]

可因特网获取蛋白酶构造域的正文和一段距离数据

ArrayExpress [ ]

数据来自EMBL的高通量功能DNA组学测试的数据；

BAR []

在判读DNA功能时，通常会参考DNA的容含的系统，即DNA在植可作相同组织相同发育时期的容含丰度变化。通过因特网判读comBAR对候DNA顺利进行容含判读。 是一个植可作生信判读资源com，用该com判读DNA容含时，不仅可以获DNA容含的系统的热图，还可以获可视化的电子荧光图片，抽象显现DNA在植可作组织中的容含一段距离。

GSDS []

Gene Structure Display Server，基于DNA组正文PDF绘制核酸DNA构造等功能

ProtParam []

蛋白酶特性判读是就是指蛋白酶的一些可作理和化学参数，如黏度、等电点、和原子组成、消光比值、半衰期、不有利于比值、脂肪部落就是Index、极性。这些参数，有助于顺利进行蛋白酶的特别化学合成测试。比如在活体经济制度（大肠杆霉、酵母霉等）容含和产可作目的蛋白酶时，需考虑蛋白酶的黏度、等电点、消光比值、不有利于比值和极性等。在蛋白酶能活测试中，也需根据这些参数优化测试经济制度。

Protscale []

蛋白酶的亲疏水性主要由其侧链双键R，如果R只是H或是C、H两元素组成的话，都是疏水的，如果含有极性侧链双键，如-OH、-SH、-COOH、-NH2 等，则就是极性的（游憩的）。疏水性有色氨酸、色氨酸、苯N-、缬氨酸、多肽、异多肽、N-和蛋氨酸（甲硫氨酸）。疏水性在蛋白酶质之外，在保持蛋白酶质的三级构造上，蛋白酶和基质、抗体和抗原外的基本粒子等各种非共价的分子相结合方面，不具重要依赖性。

TMHMM []

蛋白酶的跨表皮构造判读对于得出蛋白酶的亚细胞适配都和。如果不具跨表皮构造，蛋白酶很可能定设于细胞中与表皮特别的构造，如细胞质表皮、动可作细胞表皮或真核细胞表皮等内表皮系统设计。此外，蛋白酶跨表皮构造判读对于蛋白酶功能判读也有一定的设法。比如某蛋白酶没有跨表皮构造，但是亚细胞适配测试显示其可定设于表皮特别构造，这说明该蛋白酶可能通过其他表皮适配蛋白酶征募过去的。

SignalP []

岭路径一段距离为路径肽切割点，岭之前的核酸为路径肽

路径肽是就是指随时随地新的人工合成的蛋白酶质向分泌通路转到的窄肽链，常设于蛋白酶的N-末端，都由把蛋白酶质随时随地到相同表皮构造的亚细胞器内。解码分泌蛋白酶的mRNA在翻译时首先人工合成N末端的路径肽，它被路径肽识别系统蛋白酶(SRP)所识别系统，SRP将RNA携带至内质网上，内质网表皮上的 SPR 受体识别系统并与之相结合。新的人工合成蛋白酶在路径肽随时随地下到达内质网内腔，而路径肽则在路径肽蛋白酶的依赖性下被切除。由于它的随时随地，新的生的就能够通过内质网表皮进入腔内，最终被分泌到胞外。在宿主霉中容含外源蛋白酶时，可用路径肽随时随地外源蛋白酶适配分泌到胞外，大幅提高蛋白酶水溶性，在原核容含系统设计（大肠杆霉、芽孢杆霉等）和真核容含系统设计（如毕故称酵母霉）中均有运用。

NetPhos []

KinasePhos-2.0 []

蛋白酶质磷酸化就是指由蛋白酶质嘌呤催化的把 ATP 的磷酸基转到刚才可作蛋白酶质核苷酸（丝氨酸、选择性、色氨酸）上的流程，或者在路径依赖性下相结合 GTP（通常以 GTP 替换 GDP），是生可作体内一种普通的缓冲方式，在细胞细胞骨架的流程中起重要依赖性。在路径大幅提高时通过获一个或几个磷酸集团而被诱导，而在路径弱化时能去除这些集团，从而耗尽能活性。有时某个路径蛋白酶磷酸化通常造成下游的蛋白酶依次发生磷酸化，形成磷酸化反馈反应会。

二、生可作数据学的软件及下载页面：

Clustal:

MEGA:

MAFFT:

Sequence Matrix:

PGDSpider:

DnaSP v6:

Arlequin:

MapMan：

PartitionFinder:

jModelTest:

IQ-TREE:

IQ-TREE因特网:

RaxmlGUI:

Mrbayes 3.2.7:

PhyloSuite:

BEAST:

Figtree:

Tracer:

PopART:

Network:

Structure:

CLUMMP:

Distruct:

Migrate-N:

Phylonet: 或