Cell：「小身体，大智慧」Cell 重磅揭示致病染色体折叠模式及影响因素

等位基因是巨噬细胞生命大型活动的物质结构设计基础，与多种巨噬细胞处理过程便是，如特异性、DNA 修复和等位基因分立，其无论如何螺旋至关重要。所有巨噬细胞都须将自身的基因组通过螺旋压缩在一个小躯积维度当之前。

与真反应器巨噬细胞多种不同，大肠杆菌巨噬细胞没有巨噬细胞反应器，并且不想将其等位基因 DNA 包装变成近似于反应器小躯的重复结构设计单元。然而，它们一直螺旋并比较大它们的等位基因物质，逐步形变成一个动态的、有的组织的 DNA 网络，叫做类反应器（nucleoid）。

据悉，美国耶鲁大学 Christine Jacobs-Wagner 科学研究小组在 Cell 杂志上发表了篇文章 Interconnecting solvent quality， transcription， and chromosome folding in Escherichia coli 的文章，了解到了致病之前的等位基因螺旋规律。

在本科学研究之前，所写采用巨噬细胞的简单弹性躯物理学多角度，将巨噬细胞膜视作弹性躯溶剂，其之前弹性躯是 DNA，组分是巨噬细胞膜之前的其他所有物质（例如，水、代谢物、倍受躯质、RNA和 RNA）。

根据弹性躯-组分相作用，组分的准确性大致分为三种种类：单纯、良好和更差。

在良好物理现象的组分之前，弹性躯和组分两者之间的相作用优于弹性躯多肽段两者之间的相作用。意味著，在不好组分之前，弹性躯多肽段两者之间的相作用比它们与组分的相作用不够有利。单纯长时间则是厌恶和吸引相作用被相抵销。

类反应器范围内 DNA 含量（图表来源不明：Cell）

致病巨噬细胞之前的特异性千分之类反应器微小

在微量元素贫乏和微量元素多样化的前提下，巨噬细胞 DNA 含量和类反应器微小基本保持不变。

为了人造卫星类反应器几何躯微小，科学研究医护人员使用致病大肠杆菌（CJW6340，表达带有 GFP 标记的人工设计的倍受躯质，该倍受躯质自拆解变成 25 nm 的 60 个亚基十二面躯纳米腺体）透过单光子搜索科学研究。

单光子搜索科学研究结果显示类反应器不发挥作用维度位阻，整躯千分之均方位移与布朗运动一致，推测千分之类反应器几何躯规格> 25 nm。

使用不够大的样品 GFP-μNS 基质（千分之微小为 58 nm）的样品，发现其导向在巨噬细胞极区（即远离类反应器）的不太可能性减少，估计特异性千分之类反应器几何躯微小共约为 50 nm。

特异性千分之类反应器几何躯规格的估计（图表来源不明：Cell）

巨噬细胞膜是等位基因的不好组分并促进等位基因结构设计可定义的逐步形变成

通过等位基因过渡态的 3D 蒙特卡罗精心设计将致病等位基因利用计算机为自由连接的多肽，更改相邻 DNA 短片两者之间本质范围的共约束，以精心设计组分准确性。

精心设计了解到了多种不同组分前提下等位基因过渡态的巨大更差异：

相比之下单纯和良好的组分前提，在不好组分前提下，DNA 运动速度其实在维度上不够加不光滑，与用激像素荧光影像捕捉到的大肠杆菌类反应器 DNA 运动速度的维度复合性一致。相比于良好的组分，巨噬细胞膜的不好组分物理现象可以避免多至 60 倍的等位基因增压器。

在不好组分之前，DNA 短片往往彼此不够接近，避免逐步形变成 DNA 运动速度很低的区可定义与 DNA 运动速度很低的区可定义交错。这种 DNA 运动速度的维度复合性产生了空洞现象，以减少表面的千分之几何躯规格，并而无须不够大的物躯通过。

而在单纯和良好的组分前提下，类反应器 DNA 运动速度在维度上不够加光滑，千分之几何躯规格相当大。

巨噬细胞膜之前有效率的不好组分可以促进等位基因结构设计可定义（domain）的逐步形变成，这种结构设计近似于 Hi-C 科学研究之前所见过的核仁彼此两者之间POD（CIDs）。只有在较更差组分前提下才能看到大的可定义状结构设计。

致病等位基因过渡态在多种不同种类组分之前的精心设计（图表来源不明：Cell）

类反应器躯内RNA运动速度的维度复合性与DNA运动速度红褐色肥大

RNA主要以烷基RNA形式发挥作用，富集在类反应器区可定义值得注意。断层重建和RNA导向结果显示，RNA运动速度离地不光滑。除了预料的RNA在巨噬细胞四周富集以外，RNA在巨噬细胞膜之前表现变成运动速度的复合性，包括在巨噬细胞的之前心区可定义 (即类反应器区)。

在类反应器躯内，RNA荧光频谱与 DNA 频谱红褐色肥大，这说明巨噬细胞膜的不好组分物理现象是避免 DNA 运动速度不光滑的情况，而 DNA 运动速度不光滑又反过来不良影响了RNA的导向。

致病层析图之前RNA的维度栖息于（图表来源不明：Cell）

RNA运动速度与类反应器范围内的 DNA 红褐色肥大（图表来源不明：Cell）

多种不同组分之前等位基因微小的精心设计结果（图表来源不明：Cell）

核苷酸是避免巨噬细胞膜不好组分物理现象的情况

如果烷基RNA交通堵塞是反应器样的关系化的主要促进考量，那么这个假说确信，即使核苷酸不倍受不良影响，烷基RNA重元素的减少也则会避免类反应器样扩张。

为了化验这种不太可能性，所写用杜平霉素（Ksg，一种类似的 RNA 翻译者启动减缓剂）处理处理过程致病巨噬细胞，以将烷基RNA转化为游离的RNA亚一个单位和无RNA的 mRNAs，减少烷基RNA的重元素。

所写发现巨噬细胞与 Ksg 孵育 40 分钟后类反应器躯并没有增大，大多数类反应器躯看慢慢地不够加精细，巨噬细胞之前可辨别类反应器躯的%-显着减少。

Ksg 处理处理过程避免类反应器向彼此移动与合并。这种聚合能界面相作用缩小，促进类反应器躯和 RNA 两者之间的分立。

而在利福平（Rif，一种广谱抗生素药物）处理处理过程后，RNA 人工合变成暂停，核苷酸减缓，反应器质比率 (反应器质占地相加巨噬细胞占地) 减少，反应器质发生膨胀。这些结果表明 RNA 水平就越，RNA 和 DNA 两者之间的分立就越，反应器样结构设计越的关系。

总之，DNA 和 RNA 两者之间的厌恶作用，避免了等位基因巨噬细胞膜的不好组分物理现象。

RNA/DNA 分立和类反应器紧运动速度（图表来源不明：Cell）

避免巨噬细胞膜不好组分物理现象的考量

类反应器倍受躯（NAPs）和其他 DNA 混合倍受躯（如核苷酸调节倍受躯）是与等位基因相作用的考量之一。倍受躯与阴离子 DNA 弹性躯的混合能大面积彻底改变等位基因的静电势，通过弯转扭曲 DNA 减少 DNA 螺旋总长度，进一步彻底改变类反应器躯的压缩相对和几何躯规格。

很低离子其中心的巨噬细胞膜也不太可能避免较更差的组分物理现象。排泄科学研究表明，随着盐含量的减少，DNA 短片两者之间的净相厌恶减少。OH镁离子不仅可以屏蔽 DNA 上的电荷，还可以诱导 DNA 短片两者之间的相吸引。

分子动力学精心设计表明，糖类交通堵塞可以被视作直接降很低组分物理现象。因此，烷基RNA重元素的叠加、很低 RNA 水平与 RNA/DNA 分立度和类反应器的关系相对增大相关。

在 CID 可定义的边界，很低核苷酸活性避免新生 RNA 积累。这些 RNA 一直通过 RNA 聚合酶与 DNA 混合，不能传播。所写推测，为了尽量减少与这些混合 RNA 的接触，DNA 多肽通过以外周降很低其边界处的大面积运动速度，在边界两端逐步形变成密集的 DNA 区可定义。

科学研究亮点：

致病作为类似的模式生物，是科学研究得最为详尽的原反应器大肠杆菌。它们的等位基因被前段类反应器，但对于等位基因压缩和结构设计可定义的逐步形变成还没有无论如何解释。

本科学研究之前提变成了一种预测致病之前类反应器千分之几何躯微小的方法。当巨噬细胞被视作简单的半挥发弹性躯溶剂时，巨噬细胞膜表现为等位基因的不好组分。

不好组分物理现象则会避免等位基因松软和 DNA 运动速度复合性，复合 DNA 运动速度与类反应器内的RNA运动速度红褐色肥大，并发现 RNA 也则会避免不好的组分物理现象。该科学研究将等位基因松软和结构设计可定义逐步形变成与核苷酸和巨噬体内的组织联系慢慢地，对等位基因逐步形变成的机制有了不够深入的了解。

图表来源不明：Cell

原始变成处：

Yingjie XiangIvan V. SurovtsevYunjie Chang， et al. Interconnecting solvent quality， transcription， and chromosome folding in Escherichia coli. CellVol. 184Issue 14p3626–3642.e14.